伊吾工业加工区最大优势是其丰富的煤炭资源和农牧产品资源条件，这不仅为其发展煤化工及农牧产品加工提供了有力的支撑，“十三五”和“十四五”期间，将有淖毛湖—红柳河重轨电气化铁路运煤专线、将军庙—柳沟铁路大通道、京新高速公路（北京-张家口-乌兰察布-呼和浩特-包头-临河-额济纳旗-哈密-乌鲁木齐，全长2540公里）将建成通车，G331线辽宁丹东-阿勒泰哈巴河县沿边国道建成通车（其中哈密境内段约506公里），伊吾产业园区借助于优越的对外交通条件，将为现代物流业的发展奠定基础，有条件发展专业交易中心、大宗货物市场、第三方物流等多重功能，成为区域内重要的煤炭资源及相关产品集散枢纽和农牧副产品加工配送基地。